בשנת 1906, 10 שנים לאחר המשחקים האולימפיים הראשונים באתונה, נערכה אולימפיאדה יוצאת דופן, שלא התבוננה בה. ההחלטה של יוון לקיים אותה בתחילה עוררה ביקורת חריפה על כמה וועדות אולימפיות. עם זאת, בהדרגה דעתם השתנתה לטובה בגלל העובדה שמדינות רבות לא יכלו לשלוח קבוצות רציניות לסנט לואיס או אפילו לא השתתפו במשחקי 1904 בגלל העלות הגבוהה של הדרך לארצות הברית.
המשחקים האולימפיים, שהונעו בצללים על ידי ירידים בינלאומיים, חוו משבר ממושך. על רקע מצב זה, הורשו ליוונים, כשומרי התרבות ההלנית הקדומה, לקיים את האינטר-אולימפיאדה. למרות העובדה שאולימפיאדת אתונה בשנת 1906 הייתה האירוע הראשון והיחיד מסוג זה ותוצאותיו לא הוכרו כרשמיות, התמודדו המארגנים עם המשימה: להפיח חיים בפרויקט מבולבל.
הפורום היווני, שלא כמו שני קודמיו הרשמיים, לא הוארך במיוחד בזמן והצליח להפוך לאירוע חובק עולם, לאחר שאסף לתחרות קהל שיא לאותה תקופה - 884 ספורטאים, שייצגו 20 מדינות.
לראשונה בתולדות המשחקים, כל המשתתפים עברו את הליך הרישום בוועדות האולימפיות הלאומיות. כמו כן, לראשונה, הצופים צפו בטקסי הפתיחה והסגירה של המשחקים, במצעד האולימפי ועלייתם של כרזות לאומיות לכבוד הזוכים ביציע.
סקרנות הן העובדות הנוגעות ישירות למשתתפים באולימפיאדת 1906. ריי אורי, ספורטאי אלוף אולימפי בן שמונה במז'ימפיאד, זכה בקפיצה לרוחק ממקום (3 מ '30 ס"מ) ובקפיצה לרוחק ממקום (1 מ' 56 ס"מ). אם התוצאות הללו היו נלקחות בחשבון, הוא היה גובר על פאבו נורמי וקארל לואיס בזהב (9 מדליות זהב כל אחת). ריי אורי כבר לא הורשה להשתתף באולימפיאדת שטוקהולם בשנת 1912 בגלל גילו, הוא היה בן 39.
פול פילגרים, רץ מארצות הברית, זכה בשני מרחקים 400 ו 800 מטר. תוצאה זו חזרה על עצמה רק לאחר 70 שנה על ידי הספורטאי אלברטו ג'ואנטורנה באולימפיאדת מונטריאול.
האצן הקנדי בילי שרינג הגיע ליוון חודשיים לפני המשחקים בכדי להסתגל לתנאים המקומיים. מאמציו לא היו לשווא: הוא זכה במפתיע במרתון לכולם. יורש העצר של יוון גאורג, יחד עם שרינג, ניהלו את המחזור האחרון באצטדיון.
במשחקי האולימפיאדה ב -1906 הופיעו אתלטים של פינלנד לראשונה וזכו מייד בזהב. ורנר ירווינן קיבל מדליה על השלכת דיסק בסגנון עתיק.
את מספר הפרסים הגדול ביותר באולימפיאדה זכה אירי-אמריקאי, מרטין שרידן. הוא קיבל זהב עבור זריקת הכדור וזריקת הדיסקוס בסגנון הקלאסי. לקפיצות ארוכות וגבוהות ממקום קיבל כסף. מלך יוון הגיש לשרידן חנית של הזוכה, שעדיין מאוחסנת במולדת הספורטאי באירלנד.